Со своими разнообразными функциями таможенная служба может справиться лишь имея хорошо отлаженную и мощную администрацию, которая опирается на применение современных технических средств.
В рамках таможенной службы работает около 40 000 человек, примерно в 600 подразделениях разного уровня выполняют различные функции, в зависимости от распределения работы и специализации.
Такое взаимодействие охватывает контроль зеленых границ, таможенное оформление грузов в таможнях и работу подразделений по проверок на предприятиях, оперативно-розыскные таможни, подразделения по уголовным и административным правонарушениям, а также принудительное взыскание просроченных сумм обязательных платежей с должников. В рамках таможенной службы это: Таможенно-криминальное ведомство в г. Кельн и Федеральное управление по спиртовой монополии в м.Оффенбах.
Свою деятельность на местах выполняет 99 главных таможен в которых закреплено 412 таможен и примерно 54 таможенных комиссариаты. К этой деятельности относится не только таможенное оформление трансграничной обращения с третьими странами и взыскания акцизов, но и все описанные выше функции.
В местных таможенных подразделений относятся также оперативно-розыскные таможни с своими отделениями. их деятельность начинается тогда, когда дело связано с раскрытием и преследованием нарушений правовых норм.
Более важное значение, чем иерархическая структура таможенной службы, для граждан и особенно для предприятий имеет равномерное территориальное разветвленность таможенной службы по всей Германии, что обеспечивает оперативную бесперебойную сотрудничество с предприятиями.

Департаменты таможенных платежей и акцизов главных финансовых дирекций в первую очередь выполняют централизованные функции в сфере организации дел, персонала и бюджета таможенной службы.
Главные таможни является базовой структурой таможенной администрации. У них в их «Помощниках», в таможнях работает 80 процентов всех работников. К их основным функциям относится таможенное оформление товаров и граждан, которые перемещаются в третьи страны и связанное с этим, взимания таможенных платежей. Кроме этого, они ответственность за соблюдение соответствующих положений о защите человека, охраны природные безопасности экономики.
Особое значение имеет взыскания акцизного сбора с отечественных производителей.
Классическая функция таможенной службы, а именно таможенное оформление грузов, ввозимых третьих стран, выполняется совместно пограничными главными таможнями, расположенными на границе с третьими странами, и внутренними главными таможнями. Это возможно благодаря тому, что товары с границы до главной таможни, расположенной в середине страны, перевозимых в рамках так называемого внутришньомитного транзита и подаются к таможенному оформлению только внутренней таможне.
Организационные подразделения высшего ранга - главные таможни - обеспечивают общие условия для надежного таможенного оформления и занимаются предупреждением нарушений. В связи с этим в них наряду с обычными отделами таможенных платежей являются структурные подразделения по вопросам персонала, организации дел и бюджета таможенной администрации в рамках их административного округа.
К компетенции главных таможен относится также рассмотрение жалоб (возражений) или предоставление допусков, разрешений и лицензий. В структуру главных таможен входят также подразделения по уголовным и административным правонарушениям, подразделения по принудительного исполнения, отделы внешней проверки на предприятиях, контрольные группы по борьбе с нелегальной работой и мобильные контрольные группы.
Задача подразделений по проверке на предприятиях заключается в проверке учета и отчетности предприятий по соблюдению ими акцизных и таможенных правовых норм и обеспечение тем самым полной уплаты таможенных платежей. В связи с переносом контрольной деятельности таможенной службы с границы на предприятия декларантов и особенно, начиная с создания внутреннего рынка Евросоюза, деятельность этих подразделений имеет важное значение. Они часто являются первой инстанцией, которая может провести глобальную проверку. Подразделениями по проверке являются:
• специализированные главные таможни по проверке, которые отвечают за административный округ данной главного финансового управления;
• отделы по внешней проверки и налоговом надзора главных таможен.
Эти подразделения контролируют также соблюдение положений внешнеэкономического права, частности относительно запретов и ограничений на ввоз и вывоз товаров, как, например, нарушений по соблюдению эмбарго и надлежащее регулирование рынка разнообразных сельскохозяйственных товаров. В настоящее время проверяется и контролируется таким образом деятельность примерно 100 000 предприятий.
Таможни созданы с целью своевременного и удобного для экономики выполнения различных функций главных таможен. Они контролируют фактический ввоз, вывоз и перевозки товаров, устанавливают размер таможенных платежей и стягивают их. Территориальное размещение таможен и главных таможен зависит от потребностей экономики и транспорта. Они расположены на всех важных в транспортном отношении пограничных переходах, в аэропортах, в морских и речных портах или непосредственно возле вокзалов и хозяйственных центров.
С целью предотвращения угроз внутренней безопасности и налоговым недоборам таможенная служба осуществляет свои контрольные полномочия не только на границе с третьими странами, но с помощью мобильных контрольных групп и по всей территории страны.
Контрольные группы на основании Закона о таможенной службе ведут надзор за оборотом товаров, происходящих из третьих стран, за соблюдением положений о запрещении и ограничения (например, относительно наркотиков, оружия, радиоактивных веществ, отходов, или тех видов фауны и флоры, находящихся под защитой) и контролируют коммерческий оборот подакцизных товаров.
К их полномочиям относится задержание лиц и транспортных средств, а также проведения досмотра багажа, транспортных средств и грузов. В приграничных районах данные полномочия действуют без ограничений на территории до 30 км в середину страны. На остальной территории ФРГ такие полномочия мобильные контрольные группы должны в случаях, когда есть основания полагать, что ввозимые товары, подлежащие таможенному контроля.
В рамках различных функций таможенной службы появляется необходимость точного анализа и экспертизы товаров с целью выяснения вопросов правильной таможенно-тарифной классификации товара, при установке соответствующей ставки налогообложения, при начислении компенсационных выплат по рынку сельскохозяйственных товаров или в случаях подозрения в нарушении внешнеэкономического права.
В таможенно-технических лабораториях и базах подготовки работают специалисты разного профиля. В распоряжении таможенной службы есть современные приборы и оборудование, постоянно обновляются в соответствии с уровнем технологического прогресса. К функций подразделения относится и выдача официальных справок по таможенному тарифу, которые являются действительными для таможенного оформления товаров на всей территории Евросоюза.
Кроме этого, таможенно-технические лаборатории и базы подготовки регулярно проводят курсы и семинары, что является значительным вкладом в профессиональную переподготовку и повышение квалификации таможенников.
Базы таможенного обучения на региональном уровне выполняют такие же функции как таможенно-технические лаборатории и базы подготовки. Однако, официальных справок они не выдают том, что их анализ не основывается на научных знаниях и методах.
В направлении дознания и уголовного преследования работают таможенно-уголовное ведомство (как федеральное ведомство главного уровня), оперативно-розыскные таможни и подразделения главных таможен по уголовным и административным правонарушений.
Древняя традиция имеет сотрудничество таможенных и полицейских органов Германии. Это сотрудничество осуществляется теперь в пределах 28 совместных групп расследования. Помимо таких совместных групп, которые создаются при потребности в постоянном взаимодействии, существуют группы осуществляющих временную сотрудничество.
Таможенная служба пограничной охраны осуществляет контроль за так называемым зеленым границе с третьими странами протяженностью 1 692 км.
Патрульная пограничная служба, организованная в круглосуточном и переменном по времени и месту режиме, призванная предупредить уклонение от уплаты ввозных таможенных платежей и нелегальный ввоз или вывоз товаров. Таможенная служба пограничной охраны за поручению Федерального министерства внутренних дел осуществляет также функции пограничной полиции.
Водная таможенная служба обеспечивает контроль за зеленым рубежом по Северному и Балтийском морях, в прибрежной зоне и на всех пограничных водоемах. Кроме того, эта служба, как часть созданной до 1 июля 1994 года береговая охрана, вносит свой вклад в обеспечение морской безопасности на открытом море. Это служба, часто даже без особых на то правил, осуществляет быструю и решающую помощь при спасении людей и судов в случаях морских аварий или несчастных случаев на внутренних водоемах.
Подготовка и повышение квалификации
В городах Мюнстер, Плессов и Зигмаринген таможенная служба имеет три учебных центра, которые непосредственно подчиняются Федеральному министерству финансов. Задача учебных центров заключаются в подготовке молодых кадров и будущих служащих для подразделений среднего и высшего уровней, а также в повышении квалификации сотрудников федеральной финансовой администрации.
В г. Мюнстере функционирует выше специализированной школе федерации государственной администрации (отдел финансов) в рамках среднего специального образования, где проходят подготовку молодые кадры.
Пять таможенно-технических лабораторий и баз подготовки и 12 баз таможенного обучения принимают участие в подготовке кадров путем организации на региональном уровне учебно-подготовительных мероприятий, сопровождающих практический цикл их обучения. Кроме этого на их базе регулярно проводятся общестроительные федеральные или региональные меры повышения квалификации таможенников.
Переподготовкой и повышением квалификации таможенников занимаются также 2 таможенных училища. Здесь также проводятся семинары и курсы обучения, направленные на углубление существующих и передачу новых знаний.
Для проводников таможенных и служебных собак также организована основательная подготовка.
Информационная техника
При выполнении своих функциональных обязанностей таможенная служба использует большое количество процедур, для выполнения которых используется информационная техника. Применение информационной техники в Германии поддерживает 7 вычислительных центров в городах Берлин, Дюссельдорф, Франк-Фурт-на-Майне, Гамбург, Ганновер, Карлсруэ Штутгарт, а также работа по компьютеризации при Таможенно-уголовном ведомстве в г. Кельн. Эти подразделения планируют и продвигают применения централизованных компьютеризированных систем и разрабатывают соответствующие программы, направленные на облегчение и ускорение работы.
Кроме этого в каждой главной финансовой дирекции работает реферат по информации, который на региональном уровне, в пределах административного округа, отвечает за применения информационной техники.
Для выполнения особых функций в области информационной техники существует ряд централизованных подразделений, таких, например, касающиеся таможенных квот, таможенно-тарифных справок и т.п..
Особенно оправдалось применения информационной техники при таможенном оформлении товаров, а также оперативно-розыскной деятельности.